La Agencia Nacional de Investigación Financiera ha elaborado su organigrama funcional conforme al Decreto núm. 112/2019, de 9 de septiembre. La estructura se fundamenta especialmente en los artículos 1, 3, 4, 5, 6, 7, 8 y 17. Complementa este marco el Reglamento Interno de la Agencia, que regula su organización y funcionamiento.
De este modo, el organigrama garantiza el cumplimiento del régimen legal vigente.